Der Freundeskreis verfolgt folgende Ziele:
- öffentliche und vereinsinterne Veranstaltungen wissenschaftlicher und populär wissenschaftlicher Art,
- die Förderung von Publikationen aus dem Botanischen Garten und Herausgabe von vereinseigenen Informationsschriften,
- die Förderung wissenschaftlicher Forschungsvorhaben und Veranstaltungen auf dem Gebiet der Botanik am Neuen Botanischen Garten der Christian Albrechts Universität,
- Maßnahmen zum Ausbau und zur Pflege der wissenschaftlichen Pflanzensammlungen und der dazu notwendigen Einrichtungen.
Der Verein sucht dauerhaft neue Mitglieder zur Verwirklichung der Ziele und zur Erweiterung der Möglichkeiten durch die Fähigkeiten der neuen Mitglieder.